1976년 목포실업전문학교 도서실로 출발한 목포과학대학교 도서관은 지식정보사회에 부응하는 학술정보센터의 기능과 함께 문화센터로서의 역할을 수행하기 위하여 2002년 현재 위치한 구암도서관으로 신축 이전하였다.
현재 도서관에는 국내외 전문도서 및 교양도서, 참고도서, 학술지, 논문, 애니메이션자료 등의 도서자료와 DVD, VCR 등 시청각자료 및 다양한 멀티미디어 자료를 제공하고 있다. 또한 1995년 도서관전산화시스템의 도입으로 도서관 소장자료의 DB구축작업을 시작하였고, 2007년에는 21세기 지식정보사회에 부응하는 새로운 정보서비스를 제공하기 위해 WEB기반 도서관전산화시스템을 새로이 구축하였다. 현재 DB구축 및 자료관리 등의 도서관 제반업무는 전산화시스템으로 운영되고 있다.
향후 목포과학대학교 도서관은 정보센터로서의 기능과 문화센터로서의 기능이 복합된 종합학술문화센터의 기능을 갖춘 최첨단 도서관 시스템을 구축할 계획이다..